《中国中药杂志》
1 材料与方法
1.1 蠲痹汤活性成分与作用靶点的筛选
1.2 骨关节炎治疗靶点的筛选
1.3 蠲痹汤交集治疗靶点的筛选
1.4 蠲痹汤“活性成分—治疗靶点”网络图绘制
1.5 蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络的构建及核心靶点的筛选
1.6 基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析
1.7 分子对接
2 结果
2.1 蠲痹汤活性成分及靶点筛选
2.2 蠲痹汤治疗骨关节炎的治疗靶点
2.3 蠲痹汤“活性成分—治疗靶点”网络图构建
2.4 PPI网络的构建和核心靶点的筛选
2.5 GO富集分析
2.6 KEGG富集分析
2.7 分子对接
3 讨论
3.1 骨关节炎的中医治疗
3.2 蠲痹汤通过抗炎、抗凋亡、调控软骨细胞代谢和促进软骨下骨重建等治疗骨关节炎
3.3 中药与组织工程研究
3.4 小结
文章摘要:目的采用网络药理学和分子对接探讨蠲痹汤治疗骨关节炎的机制。方法应用TCMSP数据库获取蠲痹汤的活性成分和对应靶点,检索GeneCards数据库、OMIM数据库、PharmGkb数据库和TTD数据库获得骨关节炎的治疗靶点。运用R语言软件(版本4.0.2)获得蠲痹汤治疗骨关节炎的交集靶点,使用Cytoscape软件(版本3.8.0)构建"活性成分—治疗靶点"网络并将关键成分进行排序,同时通过蛋白质相互作用(PPI)网络筛选出其核心靶点。运用R语言软件对蠲痹汤治疗骨关节炎的作用靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。运用AutoDockVina(版本1.1.2)等软件对上述核心靶点及关键成分进行分子对接验证。结果应用TCMSP数据库共得到蠲痹汤活性成分165个及对应靶点2 529个,药物药效靶点与骨关节炎治疗靶点取交集得到115个靶点,关键成分有槲皮素、山柰酚、柚皮素等,核心靶点有STAT3、TNF、MAPK14等。GO富集分析得到2 306个生物过程条目,144个分子功能条目,69个细胞组成条目; KEGG富集分析得到TNF信号通路、IL-17信号通路、PI3K-AKT信号通路等相关通路。分子对接结果显示,蠲痹汤治疗骨关节炎的关键成分槲皮素、山柰酚、柚皮素、甘草酮A、刺芒柄花素与其对应的核心靶点有较好的结合性。结论蠲痹汤可能通过多成分、多靶点、多通路的相互作用发挥对骨关节炎的治疗作用。
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